O NUTES está sediado no 2º andar do Hospital das Clínicas da Universidade Federal de Pernambuco (HC/UFPE), em Recife, Pernambuco.
Com uma área de 200 m², o Núcleo dispõe de uma infraestrutura tecnológica com um parque superior a 50 estações de trabalho, servidores em alta disponibilidade conectados à Internet por meio da rede do campus universitário, e equipamentos para videocolaboração e para realização de exames complementares digitais.

A conexão com a internet é realizada através de um link de 1Gbs ligado à UFPE e conectado diretamente com a Rede Nacional de Pesquisa (RNP) e com serviços do Hospital das Clínicas através da Rede Universitária de Telemedicina (RUTE).